VetorBuilder의 ORF library는?
- VectorBuilder는 human whole-genome ORF (Open Reading Frame) 다양한 요구 사항에 대한 library 제작 및 스크리닝 서비스를 제공
- 개별 ORF 클론의 시퀀스가 검증되었으므로 모든 백본에서 pooling 또는 array 형식으로 커스텀 스크리닝 library를 신속하게 구축 가능
- Gain-of-function 연구 및 CRISPR 또는 RNAi 결과 검증에 이상적인 ORF library는 유전자 기능, 질병 메커니즘 및 치료제 반응에 사용 가능
서비스 주요 특징
주요 서비스 내용
| Service Module | Description | TAT |
Library Design
| VectorBuilder의 라이브러리 전문가와 상담을 통해 진행됩니다. 알맞은 delivery system, promoter, tag, marker를 고객의 스크리닝 전략에 따라 안내합니다. 높은 signal-to-noise ratio와 unbiased readout을 위해 벡터 설계 최적화를 진행합니다.
| 1-4 days |
Library Cloning
| 염기서열이 확인된 ORF를 원하는 백본벡터에 대량 parallel cloning 후 QC를 진행합니다
Pooled library: 높은 커버리지와 균일성을 보장합니다. 결과물은 glycerol stock, plasmid, 고역가 virus로 제공됩니다.
Arrayed library: 96- 또는 384-well plate나 matrix tube로 제공됩니다.
| 2-3 days |
Virus Packaging
| Library plasmid를 고역가 virus로 패키징하여 high-fold, uniform coverage를 제공합니다. | 문의 |
Pooled Library Screening
| Pooled ORF library에 대한 체내외 스크리닝을 수행합니다. 설치류 또는 비인간 영장류(NHP) 모델을 이용해 체내 스크리징이 수행됩니다. DNA 또는 RNA 수준에서 판독을 용이하게 하기 위해 바코드를 삽입할 수 있습니다.
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Hit Identification
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스크리닝된 세포의 gDNA 또는 RNA, NGS sequencing, hit analysis 등 스크리닝 후 단계 처리해 드립니다. Raw 및 processed 시퀀싱 데이터를 결과 보고서로 제공해 드립니다.
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Pooled vs. arrayed libraries비스 주요 특징
| Attribute | Pooled Library | Arrayed Library |
Construction
| All barcoded ORF-carrying plasmids/viruses pooled into a single mixture
| Individually isolated ORF-carrying plasmids/viruses placed in multi-well plates
|
Screening
| High-throughput screening
| Systematic study of each ORF
|
Approach
| Across thousands of ORFs simultaneously, with reference and experimental groups
| Independently, one ORF per well |
Advantages
| Quick, cost-effective for large-scale studies, allows simultaneous analysis of numerous ORFs
| Precise control over experimental conditions, reduces cross-contamination
|
Limitations
| Challenging to identify specific ORFs responsible for phenotypes without additional deconvolution and validation steps
| More labor-intensive and expensive due to individual handling and analysis
|
*제품문의 T. 031-728-3239, E. dawinbio@dawinbio.com
#VectorBuilder #다윈바이오 #Human_library #ORF_library #Screening
VetorBuilder의 ORF library는?
- VectorBuilder는 human whole-genome ORF (Open Reading Frame) 다양한 요구 사항에 대한 library 제작 및 스크리닝 서비스를 제공
- 개별 ORF 클론의 시퀀스가 검증되었으므로 모든 백본에서 pooling 또는 array 형식으로 커스텀 스크리닝 library를 신속하게 구축 가능
- Gain-of-function 연구 및 CRISPR 또는 RNAi 결과 검증에 이상적인 ORF library는 유전자 기능, 질병 메커니즘 및 치료제 반응에 사용 가능
서비스 주요 특징
주요 서비스 내용
Pooled library: 높은 커버리지와 균일성을 보장합니다. 결과물은 glycerol stock, plasmid, 고역가 virus로 제공됩니다.
Arrayed library: 96- 또는 384-well plate나 matrix tube로 제공됩니다.
스크리닝된 세포의 gDNA 또는 RNA, NGS sequencing, hit analysis 등 스크리닝 후 단계 처리해 드립니다. Raw 및 processed 시퀀싱 데이터를 결과 보고서로 제공해 드립니다.
Pooled vs. arrayed libraries비스 주요 특징
*제품문의 T. 031-728-3239, E. dawinbio@dawinbio.com
#VectorBuilder #다윈바이오 #Human_library #ORF_library #Screening