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CustomTissue 내 다양한 세포들의 변화를 각각 살펴보고 싶다면?

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Single Cell Analysis


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 조직은 독특한 기능을 가진 수많은 유형의 세포들로 구성되어 있으며, 세포의 subpopulation 사이에 이질성(heterogeneity)이 관찰됩니다. 이러한 complexity로 인하여 조직 내 세포들의 특징을 정확하게 파악하기 위해서는 개별 세포를 분리하여 분석하여야 합니다.

 Single cell RNA-seq은 샘플 내 단일 세포 레벨에서 유전자들의 발현양을 파악하는 NGS 기술입니다. 시료 내 존재하는 세포의 분포를 파악할 수 있고, 희귀하거나 알려지지 않은 세포 유형을 규명할 수 있으며, Pseudotime 분석을 통해 세포 유세형 간의 상태 변화나 분화 과정 등의 추정이 가능합니다.

 또한 추가적인 분석을 통하여 통해 B cell/T cell receptor의 V(D)J 재조합 데이터와 clonetype 데이터를 융합하여 시료의 immune repertoire를 확인하거나, 전사인자 또는 히스톤 단백질들의 chromatin accessibility로 확인할 수 있습니다.

 테라젠바이오는 단일 세포의 품질을 측정하여 저품질의 세포들을 제거하여 정확한 유전자 발현양상을 확인할 수 있으며, 이를 기준으로 세포 유형을 예측 및 분석하여 유전자 발현 변화 정보를 제공합니다. 또한 조직의 경우 single cell dissociation 부터 진행이 가능하여 실험 내 bias를 최대한 줄일 수 있습니다.


Application분석 목적AnalysisSample required
Single cell RNA-seq
단일 세포에서의 유전자 발현량 확인- 10x Genomics cell ranger software
- T-SNE
- Heatmap
- DEG analysis between clusters
- 유저 친화적 html report 제공		- 10^6 cells/ml
(70% viability)

Tissue : 별도 문의
(Dissociation 가능)
Single cell nucleus RNA-seq
Single cell dissociation이 어려운 sample에서 유전자 발현량 확인 (Frozen tissue 등)
Single cell TcR/BcR profiling
단일 세포 레벨에서 clonetype 분석
Single cell ATAC-seq
단일 세포의 Chromatin accessibility


문의 : 031-728-3238 / technical@dawinbio.com

Long Read Sequencing이 필요한 이유는 무엇인가요? (주)테라젠바이오를 통해 High-quality NGS data를 만나실 수 있습니다.
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