DNA methylation 실험을 QIAGEN이 도와드립니다
DNA methylation는 Guanine 앞 Cytosine의 5번 탄소에 methyl group이 첨가될 때 DNA methyltransferases에 의해 촉매되는 반응입니다.
진핵 생물에서 DNA methylation은 DNA 합성 후 일어납니다.
DNA에 존재하는 CpGs의 6-70%가 메틸화되어 있으며, CpG가 아닌 부위에서도 발견됩니다.
DNA methylation은 DNA의 염기서열이 유지되면서 유전기능이 변화되고 자손까지 전달되는 후생유전학의 대표기전입니다.
QIAGEN은 다음과 같은 DNA methylation workflow를 보유하고 있습니다.
- 단 1 - 10 ng의 DNA 사용으로 조직, FFPE 및 Biofluid의 고성능 분석이 가능합니다.
- 하루 만에 DNA 추출부터 데이터 분석까지 가능합니다.
- 프로젝트에 맞게 패널을 맞춤화하거나 설계할 수 있는 유연성이 있습니다.
1. Bisulfite Treatment Kit - Unmethyl cytocine을 uracil로 99%이상 전환 가능합니다!
*96 well plate rotor 또는 [19504]QIAvac 96 필요
EpiTect Fast DNA Bisulfite Kit를 이용해 K562 genomic DNA에 bisulfite 처리한 결과입니다. 총 1,252개의 cytosine을 분석하였을 때 99% 이상 cytosine conversion이 되는 것을 확인할 수 있습니다. | 
EpiTect Fast Bisulfite Kit를 이용하여 bisulfite conversion을 하실 경우 타사 제품에 비하여 fragmentation이 낮게 발생하는 것을 확인할 수 있습니다. 또한, 6 kb 이상 converted DNA도 확인이 가능합니다.
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2. Analysis Kit - Conversion된 DNA를 RT-PCR로 분석해 보세요!
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MethyLight 작동 원리 1. Methylation된 부위에 Primer가 부착됩니다 (A).
2. PCR의 extension 과정에서 fluorophore가 방출됩니다.
Unmethylated 부위에는 primer 부착이나 PCR의 extension 과정이 발생하지 않아 fluorescence를 확인할 수 없습니다.
MethyLight Kit를 이용하여 methylation을 쉽게 정량하실 수 있습니다. |
3. NGS - 준비한 샘플을 이용해 DNA methylation을 분석해 보세요!
* 해당 제품의 경우 홈페이지에서 별도제작 과정이 필요합니다
Jrkat cell에 bisulfite 처리된 DNA를 QIAseq Methyl Library Kit를 이용하여 library구축 결과입니다. 최소 100 pg library 구축이 가능하며, 높은 mapping rate를 확인할 수 있습니다. | 
FFPE DNA를 이용해 MGMT 유전자의 CpG 7곳의 methylation을 분석한 결과입니다. QIAseq Targeted Methyl Panel을 이용하여 CpG methylation을 분석한 결과 이전 검증된 Pyrosequencing 결과와 높은 상관관계를 보입니다. |
*제품문의 T. 031-728-3239, E. technical@dawinbiotech.com
#QIAGEN #다윈바이오 #Bisulfite #EpiTect #QIAseq #Methylation
DNA methylation는 Guanine 앞 Cytosine의 5번 탄소에 methyl group이 첨가될 때 DNA methyltransferases에 의해 촉매되는 반응입니다.
진핵 생물에서 DNA methylation은 DNA 합성 후 일어납니다.
DNA에 존재하는 CpGs의 6-70%가 메틸화되어 있으며, CpG가 아닌 부위에서도 발견됩니다.
DNA methylation은 DNA의 염기서열이 유지되면서 유전기능이 변화되고 자손까지 전달되는 후생유전학의 대표기전입니다.
QIAGEN은 다음과 같은 DNA methylation workflow를 보유하고 있습니다.
- 단 1 - 10 ng의 DNA 사용으로 조직, FFPE 및 Biofluid의 고성능 분석이 가능합니다.
- 하루 만에 DNA 추출부터 데이터 분석까지 가능합니다.
- 프로젝트에 맞게 패널을 맞춤화하거나 설계할 수 있는 유연성이 있습니다.
1. Bisulfite Treatment Kit - Unmethyl cytocine을 uracil로 99%이상 전환 가능합니다!
Column 당 30 mg의 highly pure 6xHis-tagged protein 분리 정제 가능
Cytosine conversion rate가 99% 이상
30분 이내 빠른 결과 확인
DNA protects 기술로 DNA degradation 방지
Bisulfite conversion을 하나의 Kit로 수행 가능
*96 well plate rotor 또는 [19504]QIAvac 96 필요
EpiTect Fast DNA Bisulfite Kit를 이용해 K562 genomic DNA에 bisulfite 처리한 결과입니다. 총 1,252개의 cytosine을 분석하였을 때 99% 이상 cytosine conversion이 되는 것을 확인할 수 있습니다.EpiTect Fast Bisulfite Kit를 이용하여 bisulfite conversion을 하실 경우 타사 제품에 비하여 fragmentation이 낮게 발생하는 것을 확인할 수 있습니다. 또한, 6 kb 이상 converted DNA도 확인이 가능합니다.
2. Analysis Kit - Conversion된 DNA를 RT-PCR로 분석해 보세요!
2. PCR의 extension 과정에서 fluorophore가 방출됩니다.
Unmethylated 부위에는 primer 부착이나 PCR의 extension 과정이 발생하지 않아 fluorescence를 확인할 수 없습니다.
MethyLight Kit를 이용하여 methylation을 쉽게 정량하실 수 있습니다.
3. NGS - 준비한 샘플을 이용해 DNA methylation을 분석해 보세요!
Single-primer extension을 적용해 민감하고 구체적 솔루션 제공
* 해당 제품의 경우 홈페이지에서 별도제작 과정이 필요합니다
Jrkat cell에 bisulfite 처리된 DNA를 QIAseq Methyl Library Kit를 이용하여 library구축 결과입니다. 최소 100 pg library 구축이 가능하며, 높은 mapping rate를 확인할 수 있습니다.
FFPE DNA를 이용해 MGMT 유전자의 CpG 7곳의 methylation을 분석한 결과입니다. QIAseq Targeted Methyl Panel을 이용하여 CpG methylation을 분석한 결과 이전 검증된 Pyrosequencing 결과와 높은 상관관계를 보입니다.*제품문의 T. 031-728-3239, E. technical@dawinbiotech.com
#QIAGEN #다윈바이오 #Bisulfite #EpiTect #QIAseq #Methylation