FFPE 조직에서 효과적인 핵산 추출 솔루션! : QIAGEN 제품 소개

1. Formalin-Fixed Paraffin-Embedded (FFPE) 조직이란?

1) Formalin-Fixed

- 조직 샘플을 중성 formalin에 고정시켜 단백질과 세포 구조를 안정화 시킵니다.

- 고정 과정을 통해 세포 내 효소를 불활성화하여 부패를 방지합니다.

2) Paraffin-Embeded

- 고정된 조직을 탈수한 후 파라핀 왁스에 침투시켜 굳히는 방식입니다.

2. FFPE 조직에서 핵산을 추출할 때 한계점은?

- Formalin이 단백질과 핵산 사이에 공유 결합을 형성하여 핵산 추출이 어려우며, 염기서열 정보가 변형될 수 있습니다.

- 고정 시간과 온도에 따라 핵산의 분절화가 발생합니다.

- FFPE 조직의 경우 장기간 보관하는 경우가 있어 핵산의 가수분해, 산화, 변성으로 인해 핵산 추출이 어렵습니다.

Formalin을 조직 고정은 crosslinking을 유발해 핵산 정제에 어려움을 줍니다.

3. QIAGEN이 제시하는 솔루션!

- QIAGEN FFPE Kit의 lysis buffer는 tissue section에서 RNA 손상 없이 RNA를 추출할 수 있습니다.

- DNase 및 DNase Booster buffer를 이용해 genomic DNA 오염을 제거합니다.

- MinElute spin column 적용으로 적은 양의 샘플에서 핵산을 효율적으로 추출할 수 있습니다.

- Advanced Kit의 경우 xylene-free, UCP (ultra-clean production) 가 적용되어 순도 높은 DNA 추출이 가능합니다.

- 하나의 샘플에서 DNA, RNA를 동시에 추출 가능한 AllPrep Kit도 보유하고 있습니다.

FFPE 조직 관련 제품 정보

Cat No.	Product	Description	쇼핑몰
19093	Deparaffinization Solution (16 ml)	- FFPE 조직을 이용해 DNA 또는 RNA 추출 전 deparaffinization에 사용 가능 - FFPE 조직에 첨가 시 proteinase K 과정까지 작용
56404	QIAamp DNA FFPE Kit (50)	- FFPE 조직에서 RNA 분리 정제 - 소량의 샘플에서 효율적인 핵산 추출을 위한 QIAamp MinElute 기술 적용
56604	QIAamp DNA FFPE Advanced Kit (50)	- FFPE 조직에서 RNA 분리 정제 - Xylene-free, no-wash deparaffinization으로 고품질 DNA 분리 정제 가능
56704	QIAamp DNA FFPE Advanced UNG Kit (50)	- FFPE 조직에서 DNA를 추출하는 동안 Uracil을 제거하여 고품질 DNA 정제 - Uracil-N-Glycosylase 별도 구매 가능
73504	RNeasy FFPE Kit (50)	- FFPE 조직에서 RNA 분리 정제 - 빠른 처리 과정으로 70분 내 RNA 추출 가능
217504	miRNeasy FFPE Kit (50)	- FFPE 조직에서 miRNA와 total RNA를 분리 정제 - 18 nucleotide 이상의 RNA 정제
80234	AllPrep DNA/RNA FFPE Kit (50)	- 하나의 FFPE 조직에서 gDNA와 total RNA를 동시에 분리 정제 - 소량의 샘플에서 효율적인 핵산 추출 가능

제품문의 T. 031-728-3239, E. technical@dawinbiotech.com

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DNA/RNA Prep.FFPE 조직에서 효과적인 핵산 추출 솔루션!