QIAGEN특허받은 LNA 기술을 이용한 RNA 연구

 

  

    LNA(Locked Nucleic Acids)

  • 높은 민감도 : 매우 낮은 농도로 발현돤 RNA나 liquid biopsy와 같이 복잡한 표본에서도 RNA 검출 가능 
  • 탁월한 특이도 : 밀접한 연관이 있는 서열을 정확하게 구분하여 하나의 핵산만 달라도 식별 가능 
  • 강화된 친화력 : 보다 강력하고 민감한 oligonucleotide로 설계되어 probe 또는 primer 제작 시 짧게 제작이 가능하고 miRNA와 같은 짧은 서열 연구의 어려움 해결 
  • 열 안정성 향상 : 원하는 곳에 probe 또는 primer 부착이 가능하여 GC 비율과 상관없이 일정하게 검출 가능 
  • exo- and endonucleases 내성 : 생체 밖 및 생체 내에서 안정성 유지 
LNA(Locked Nucleic Acids)는 ribose ring이 고정된(locked) 입체적 구조로 되어있어, 왓슨-크릭 base-paring 강도를 더욱 강화해 주는 고 친화력 RNA 유사체입니다. 


■ 탁월한 결합 친화도 - GC 함량과 무관 

 LNA 치환으로 Oligo melting temperature를 높여, oligonucleotides의 길이나 GC 함량과 무관하게 Tm값을 조정하고 표준화 할 수 있습니다. LNA는 짧고 친화성 PCR primer, 검출용 probe, antisense oligonucleotides 설계에 최적화되어 있습니다. 

 그림1. DNA를 LNA로 치환하였을 때, melting temperatures 상승



■ 특별한 miRNA qPCR 시스템 

 

그림2.다양한 샘플 종류에 적용 가능

 


miRNA에 특이적인 두 개의 qPCR primer와 universal RT의 조화 

  • 정확하며 신뢰할 수 있는 정량 가능 : 1pg에 불과한 total RNA에서 개별 miRNA를 정확하고 신뢰성 있게 정량 
  • miRNA 서열간 구분 : 하나의 핵산만 다른 miRNA 서열 구분
  • 철저한 검증 : LNA 기술이 적용되고 Tm이 표준화된 primer 
  • 쉽고 빠른 프로토콜 : 3시간 밖에 걸리지 않고, pepetting을 최소화한 따라하기 쉬운 프로토콜
  • 다양한 대조군 옵션 : RNA 분리, RT, PCR efficiency control에 사용 가능한 대조군 
  • 데이터 분석 : GeneGlobe 데이터 분석 센터 활용 



■ miCURY LNA miRNA PCR Startet Kit  

 
miRNA 관련 실험을 처음할 때, 필요한 모든 시약이 소량으로 구성 

  • RT 반응 20회 및 PCR 증폭 100회 사용하기에 충분한 시약 제공 
  • Spike-in control template 및 primer set(UniSp6) 포함 
  • Endogeenous control primer set(miR-103a-3p) 포함 
  • 사용자가 선택할 수 있는 Primer 2 set 포함 

Ordering Information 

제품명제품번호규격비고 
miRCURY LNA miRNA PCR Starter Kit33932020rxn
cDNA 합성 kit, primer(2종), SYBR Green kit가 소량 제공 
miRCURY LNA miRNA PCR Assay339306200rxn
LNA 기술로 제작된 miRNA primer 
miRCURY LNA miRNA Custom PCR Assay339317200rxn
원하는 miRNA primer가 없을경우 직접 제작 가능 
miRCURY LNA RT Kit33934032rxn
miRNA cDNA 합성kit(20ul reaction volume 기준 32샘플 가능)
miRCURY LNA SYBR Green PCR Kit339345200rxn
SYBR Green 방식을 이용하여  detection 가능
339346600rxn
3393474000rxn

 *cDNA 합성 kit, Primer, SYBR Green kit를 모두 miRCURY 제품으로 사용하셔야 실험 결과에 guarantee가 가능합니다. 


■ miRCURY LNA miRNA Detection Probes 

그림 3. LNA를 사용하는 고 민감도 특이도로 miRNA 검출

 ISH와 IHC 이중 염색으로 세포에서 miR-205와 cytokeratin 검출(왼쪽)
 double DIG probe로 FFPE 조직 절편에서 miR-145 검출(오른쪽)

In situ hybridization(ISH) 또는 Northern blotting으로 miRNA, mRNA, IncRNA 검출 및 localization을 위한 LNA-enhanced probes 

  • 작은양의 miRNA를 검출해 내는 탁월한 민감도와 특이도
  • 모든 miRNA 종에 대해 사전 설계된 probe 및 새로운 miRNA 서열을 위한 맞춤형 probe 제작 가능 
  • DNA probe와 riboprobe를 능가하는 민감도와 특이도
  • 매우 유사한 서율을 구분하기에 이상적인 짧은 probe - e.g. splice
  • 넓은 라벨 선택 폭으로 다중 검출 및 IHC 동시 진행 가능 
  • 자동화된 대용량 ISH를 위한 표준화된 프로토콜에 적합 
  • One-day miRNA ISH 프로토콜을 이용하는 빠르고 쉬운 작업 흐름


■ miRCURY LNA miRNA miRNA Mimics and Inhibitors







동물모델에서 강력하고 효과적인 RNA Silencing
길이가 짧고 친화도가 높은 LNA antisense oligo는 세포에 자연적으로 흡수됩니다. 세포 내에서 효소 분해 내성이 있고 매우 강력한 LNA antisense oligo는 다양한 동물 조직에서 RNA를 효과적으로 Silencing하여 RNA 기능을 밝히고 그 치료 잠재력을 평가할 수 있습니다.


그림4. 형광표지(5' FAM)된 miRCURY LNA miRNA Mimics을 이용한 miRNA Silencing결과 

Ordering Information 

제품명제품번호규격비고
miRCURY LNA miRNA Inhibitor3391201nmol
GeneGlobe 
접속 후
최종 주문 번호 확인  
3391215nmol
33912215nmol
miRCURY LNA miRNA Mimic3391735nmol
33917420nmol
miRCURY LNA miRNA Power Target Site Blockers3391945nmol
33919515nmol
Antisense LNA GapmeR Standard3395115nmol
33951215nmol


*제품문의
(주)다윈바이오텍 학술마케팅팀
T.1833-8575(내선 3)/ E. technical@dawinbiotech.com 

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