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QIAGEN - RNA Prep Kits

Real-Time PCR 이나 microarray 같은 유전자 발현 분석의 경우, 실험에 사용된 RNA의 quality에 따라 결과의 신뢰도가 크게 좌우됩니다. 성공적인 실험을 위하여, QIAGEN에서는 biological sample로부터 high-quality RNA를 분리할 수 있는 포괄적인 제품 portfolio를 제공하고 있습니다.

Total RNA 정제

Total RNA 정제	Sample Type	Cat No.	Product	Description
	Cells, easy-to-lyse tissues, bacteria, yeast	74004	RNeasy Micro Kit	Total RNA 추출 (200 nt 이상) RNA cleanup
		74104	RNeasy Mini Kit
		74106	RNeasy Mini Kit
		75144	RNeasy Midi Kit
		75162	RNeasy Maxi Kit
		74034	RNeasy Plus Micro Kit	Total RNA 추출 (200 nt 이상) gDNA Eliminator columns 을 이용한 gDNA 제거
		74134	RNeasy Plus Mini Kit
		74136	RNeasy Plus Mini Kit
	All types of tissues	73404	RNeasy Plus Universal Mini Kit	200 nt 이상의 total RNA 추출 및 gDNA 제거
	All types of tissues	73442	RNeasy Plus Universal Midi Kit	200 nt 이상의 total RNA 추출 및 gDNA 제거
	Human fresh whole blood	52304	QIAamp RNA Blood Mini Kit	200 nt 이상의 total RNA 추출
	FFPE tissue sections	73504	RNeasy FFPE Kit
	Fiber-rich tissues	74704	RNeasy Fibrous Tissue Mini Kit
	Lipid-rich tissues	74804	RNeasy Lipid Tissue Mini Kit
	Plant cells, plant tissues, filamentous fungi	74903	RNeasy Plant Mini Kit
	Plant cells, plant tissues, filamentous fungi	74904	RNeasy Plant Mini Kit
	Serum, plasma, urine, other cell-free body fluids	55114	QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit	Circulating DNA, RNA, miRNA, viral nucleic acids 추출
	Liquid media	57414	QIAamp MinElute Media Kit	200 nt 이상의 Total nucleic acids 추출
	Other	74204	QIAamp MinElute Cleanup Kit	소량의 RNA cleanup 및 농축
		70022	Oligotex mRNA Mini Kit	Total RNA로부터 poly A+ mRNA만을 정제
		70042	Oligotex mRNA Midi Kit	Total RNA로부터 poly A+ mRNA만을 정제

microRNA 정제

microRNA 정제	Sample Type	Cat No.	Product	Description
	Cells, all types of tissues	217084	miRNeasy Micro Kit	microRNA를 포함한 total RNA 추출
	Cells, all types of tissues	217004	miRNeasy Mini Kit
	Serum, plasma	217184	miRNeasy Serum/Plasma Kit*
	FFPE tissue sections	217504	miRNeasy FFPE Kit
	Storaged whole blood	763134	PAXgene Blood miRNA Kit	전용 tube에 보관된 Whole blood에서 microRNA를 포함한 total RNA 추출

*miRNeasy Serum/Plasma Spike-in Control (#219610: C.elegans miR-39 miRNA mimic)과 함께 사용할 것을 권장합니다.

Viral RNA의 정제

Viral RNA는 대개 serum, plasma 등의 cell-free body fluid sample로부터 정제하며, 이 때 정제되는 RNA의 농도는 매우 낮습니다. 따라서 viral RNA를 정제하기 전 sample 내 virus particle들을 ultracentrifugation, ultrafiltration, precipitation 등을 진행하여 농축할 필요가 있습니다. QIAGEN에는 140 ul 부터 5 ml에 이르는 volume을 가진 다양한 body fluid sample로부터 viral RNA 또는 전체 핵산을 정제할 수 있는 제품이 준비되어

있습니다. Sample 내에 존재하는 viral RNA, viral DNA는 QIAamp Spin Column의 silica gel membrane에 결합되어 효과적으로 washing된 후 elution 됩니다. 이 때 필요에 따라 elution volume (20~150 ul) 은 조절될 수 있으며, 일련의 정제 과정은 spin 또는 vacuum protocol로 진행할 수 있습니다. QIAGEN의 viral RNA prep kit에는 공통적으로 carrier RNA가 포함되어 있습니다.

* Carrier RNA의 역할

① Viral RNA를 포함한 소량의 핵산이 membrane에 잘 결합할 수 있도록 도와줍니다.

② 많은 양의 carrier RNA가 추가됨으로써 RNase에 의해 viral RNA가 degradation될 가능성을 낮춰줍니다.

Viral RNA 정제	Sample Type	Cat No.	Product	Description
	Serum, plasma	53704	QIAamp UltraSens Virus Kit	Viral nucleic acids 추출 Max. sample volume: 1 ml Spin protocol
		53706
	Serum, plasma, other cell-free body fluids	57704	QIAamp MinElute Virus Spin Kit	Viral nucleic acids 추출 Max. sample volume: 200 ul, Spin protocol
		57714	QIAamp MinElute Virus Vacuum Kit^#	Viral nucleic acids 추출 Max. sample volume: 500 ul, Vacuum protocol
	Serum, plasma, urine, other cell-free body fluids	52904	QIAamp Viral RNA Mini Kit^#	Viral RNA 추출 Max. sample volume: 140 ul Spin or vacuum protocol*
		52906
		55114	QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit^#	Circulating DNA, RNA, miRNA, viral nucleic acids 추출 Max. sample volume: 5 ml, Vacuum protocol

# Vacuum protocol로 실험을 진행하기 위해서는 vacuum pump와 QIAvac 24 Plus (#19413, vacuum manifold)가 반드시 필요합니다.

동일한 sample에서 DNA, RNA, protein의 정제

동일한 샘플에서 DNA, RNA, protein을 정제하면 sample을 절약할 수 있을 뿐만 아니라 결과 분석에서도 보다 신빙성을 가질 수 있습니다. QIAGEN의 AllPrep Kit를 이용하면 하나의 protocol에서 genomic DNA, total RNA, total protein을 차례대로 분리할 수 있으며, 분리된 DNA, RNA, protein은 각각 genomic, transcriptomic, proteomic 연구에 이용할 수 있습니다.

DNA, RNA, protein 정제

AllPrep DNA/RNA/Protein Mini Kit (#80004) 를 이용하면 같은 cell 또는 tissue로부터 DNA, RNA, denatured protein을 모두 분리할 수 있습니다. 또한

Kit와 함께 Allprotect Tissue Reagent (#76405) 를 이용하면 tissue sample 내의 DNA, RNA, protein을 안정적으로 장기간 보존하면서 정제할 수있습니다.

DNA, RNA 정제

AllPrep DNA/RNA Mini Kit (#80204) 와 AllPrep DNA/RNA Micro Kit (#80284) 를 이용하면 같은 cell 또는 tissue로부터 DNA와 RNA를 동시에 분리할 수 있습니다. Sample volume에 따라 micro, mini kit을 선택할 수 있습니다.

RNA, protein 정제

AllPrep RNA/Protein Kit (#80404) 를 이용하면 같은 cell sample로부터 RNA와 native protein을 동시에 분리할 수 있습니다. 정제된 protein에는 모든 cellular protein이 포함되어 있어 enzyme assay 실험에 사용할 수 있습니다.

DNA, RNA, protein의 정제	Sample Type	Cat No.	Product	Description
	Cells & Tissue	80004	AllPrep DNA/RNA/Protein Mini Kit	gDNA, 200 nt 이상의 total RNA, denatured protein 추출
		80204	AllPrep DNA/RNA Mini Kit	gDNA, 200 nt 이상의 total RNA 추출
		80284	AllPrep DNA/RNA Micro Kit	소량의 샘플에서 gDNA, 200 nt 이상의 total RNA 추출
		80224	AllPrep DNA/RNA/miRNA Universal Kit	gDNA, microRNA를 포함한 total RNA 추출
	Cells	80404	AllPrep RNA/Protein Kit	200 nt 이상의 total RNA, native protein 추출
	FFPE tissue	80234	AllPrep DNA/RNA FFPE Kit	Genomic DNA, small RNA를 포함한 total RNA 추출

효과적인 Genomic DNA 제거

RNA를 정제하는 과정에서 함께 정제된 genomic DNA는 Real-Time PCR과 같은 정밀한 유전자 분석 실험의 정확성을 떨어뜨리는 요인이 될 수 있습니다. Genomic DNA는 PCR 과정에서 RNA와 함께 증폭, detection되기 때문에 target RNA의 정량 값을 신뢰할 수 없게 됩니다. Target RNA에 대한 특이적인 primer를 디자인함으로써 (primer가 intron splice junction에서 annealing 되도록 디자인) genomic DNA가 함께 증폭하는 것을 어느 정도 방지할 수 있겠지만, 이러한 방법이 항상 가능하지 않을 수 있습니다. 따라서 QIAGEN에서는 RNA를 정제하는 과정 또는 cDNA로 합성하기 바로 전에 genomic DNA를 효과적으로 제거할 수 있는 제품들을 보유하고 있습니다.

1. RNase-Free DNase Set : RNA 정제 과정 중 또는 RNA 정제 후 gDNA를 제거할 수 있는 DNase Set. QIAGEN의 RNeasy Mini Kit 와 함께 사용 가능

2. RNeasy Plus Kits : gDNA를 제거할 수 있는 column 또는 solution이 포함된 RNA purification kit

3. QuantiTect Reverse Transcription Kit : gDNA Wipeout Buffer가 포함된 RT kit

gDNA 제거	Step	Cat No.	Product	Description
	RNA purification 과정 중 gDNA 제거	79254	RNase-Free DNase Set	RNA 정제 과정 중 또는 RNA 정제 후 gDNA를 제거할 수 있는 DNase set
		74034	RNeasy Plus Micro Kit	Total RNA 추출 (≥ 200 nt) RNA 추출 과정에서 gDNA Eliminator Column을 이용하여 gDNA를 간편하게 제거
		74134	RNeasy Plus Mini Kit
		74136
		73404	RNeasy Plus Universal Mini Kit	Total RNA 추출 (≥ 200 nt) RNA 추출 과정에서 gDNA Eliminator Solution을 이용하여 gDNA를 간편하게 제거
		73442	RNeasy Plus Universal Midi Kit
	cDNA 합성과 동시에 gDNA 제거	205311	QuantiTect Reverse Transcription Kit	20분 만에 gDNA 제거와 cDNA 합성을 모두 완료 Kit에 gDNA Wipeout Buffer 포함
		205313
		205411	QuantiNova Reverse Transcription Kit	20분 만에 gDNA 제거와 cDNA 합성을 모두 완료 Kit에 gDNA Removal Mix 포함
		205413

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Exosomal RNA 정제	Sample Type	Cat No.	Product	Description
	Serum, plasma, cell culture supernatants, cerebrospinal fluid(CSF), urine	77144	exoRNeasy Midi Kit*	Exosome-derived total RNA 추출 Exosome 분리 RNA 정제의 2단계를 한번에 진행
		77064	exoRNeasy Maxi Kit*
		77023	exoRNeasy Serum/Plasma Starter Kit*

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