QIAGEN - RNA Prep Kits
Real-Time PCR 이나 microarray 같은 유전자 발현 분석의 경우, 실험에 사용된 RNA의 quality에 따라 결과의 신뢰도가 크게 좌우됩니다. 성공적인 실험을 위하여, QIAGEN에서는 biological sample로부터 high-quality RNA를 분리할 수 있는 포괄적인 제품 portfolio를 제공하고 있습니다.
Total RNA 정제
| Total RNA 정제 | Sample Type | Cat No. | Product | Description |
| Cells, easy-to-lyse tissues, bacteria, yeast | RNeasy Micro Kit |
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| RNeasy Mini Kit | ||||
| RNeasy Midi Kit | ||||
| RNeasy Maxi Kit | ||||
74034 | RNeasy Plus Micro Kit |
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| RNeasy Plus Mini Kit | ||||
| All types of tissues | RNeasy Plus Universal Mini Kit |
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| RNeasy Plus Universal Midi Kit | ||||
| Human fresh whole blood | QIAamp RNA Blood Mini Kit |
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| FFPE tissue sections | RNeasy FFPE Kit | |||
| Fiber-rich tissues | RNeasy Fibrous Tissue Mini Kit | |||
| Lipid-rich tissues | RNeasy Lipid Tissue Mini Kit | |||
| Plant cells, plant tissues, filamentous fungi | RNeasy Plant Mini Kit | |||
| Serum, plasma, urine, other cell-free body fluids | QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit |
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| Liquid media | QIAamp MinElute Media Kit |
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| Other | QIAamp MinElute Cleanup Kit |
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| Oligotex mRNA Mini Kit |
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| Oligotex mRNA Midi Kit |
microRNA 정제
| microRNA 정제 | Sample Type | Cat No. | Product | Description |
| Cells, all types of tissues | miRNeasy Micro Kit |
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| miRNeasy Mini Kit | ||||
| Serum, plasma | miRNeasy Serum/Plasma Kit* | |||
| FFPE tissue sections | miRNeasy FFPE Kit | |||
| Storaged whole blood | PAXgene Blood miRNA Kit |
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*miRNeasy Serum/Plasma Spike-in Control (#219610: C.elegans miR-39 miRNA mimic)과 함께 사용할 것을 권장합니다.
Exosomal RNA 정제 | Sample Type | Cat No. | Product | Description |
| Serum, plasma, cell culture supernatants, cerebrospinal fluid(CSF), urine | exoRNeasy Midi Kit* |
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| exoRNeasy Maxi Kit* | ||||
| exoRNeasy Serum/Plasma Starter Kit* |
* miRNeasy Serum/Plasma Spike-In Control(#219610) 또는 miRCURY RNA Spike-In Kit(#339390)를 별도 구매 후 함께 사용할 것을 권장합니다.
Viral RNA의 정제
Viral RNA는 대개 serum, plasma 등의 cell-free body fluid sample로부터 정제하며, 이 때 정제되는 RNA의 농도는 매우 낮습니다. 따라서 viral RNA를 정제하기 전 sample 내 virus particle들을 ultracentrifugation, ultrafiltration, precipitation 등을 진행하여 농축할 필요가 있습니다. QIAGEN에는 140 ul 부터 5 ml에 이르는 volume을 가진 다양한 body fluid sample로부터 viral RNA 또는 전체 핵산을 정제할 수 있는 제품이 준비되어
있습니다. Sample 내에 존재하는 viral RNA, viral DNA는 QIAamp Spin Column의 silica gel membrane에 결합되어 효과적으로 washing된 후 elution 됩니다. 이 때 필요에 따라 elution volume (20~150 ul) 은 조절될 수 있으며, 일련의 정제 과정은 spin 또는 vacuum protocol로 진행할 수 있습니다. QIAGEN의 viral RNA prep kit에는 공통적으로 carrier RNA가 포함되어 있습니다.
* Carrier RNA의 역할
① Viral RNA를 포함한 소량의 핵산이 membrane에 잘 결합할 수 있도록 도와줍니다.
② 많은 양의 carrier RNA가 추가됨으로써 RNase에 의해 viral RNA가 degradation될 가능성을 낮춰줍니다.
Viral RNA 정제 | Sample Type | Cat No. | Product | Description |
| Serum, plasma | QIAamp UltraSens Virus Kit |
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| Serum, plasma, other cell-free body fluids | QIAamp MinElute Virus Spin Kit |
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| QIAamp MinElute Virus Vacuum Kit# |
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| Serum, plasma, urine, other cell-free body fluids | QIAamp Viral RNA Mini Kit# |
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| QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit# |
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# Vacuum protocol로 실험을 진행하기 위해서는 vacuum pump와 QIAvac 24 Plus (#19413, vacuum manifold)가 반드시 필요합니다.
동일한 sample에서 DNA, RNA, protein의 정제
동일한 샘플에서 DNA, RNA, protein을 정제하면 sample을 절약할 수 있을 뿐만 아니라 결과 분석에서도 보다 신빙성을 가질 수 있습니다. QIAGEN의 AllPrep Kit를 이용하면 하나의 protocol에서 genomic DNA, total RNA, total protein을 차례대로 분리할 수 있으며, 분리된 DNA, RNA, protein은 각각 genomic, transcriptomic, proteomic 연구에 이용할 수 있습니다.
DNA, RNA, protein 정제
AllPrep DNA/RNA/Protein Mini Kit (#80004) 를 이용하면 같은 cell 또는 tissue로부터 DNA, RNA, denatured protein을 모두 분리할 수 있습니다. 또한
Kit와 함께 Allprotect Tissue Reagent (#76405) 를 이용하면 tissue sample 내의 DNA, RNA, protein을 안정적으로 장기간 보존하면서 정제할 수있습니다.
DNA, RNA 정제
AllPrep DNA/RNA Mini Kit (#80204) 와 AllPrep DNA/RNA Micro Kit (#80284) 를 이용하면 같은 cell 또는 tissue로부터 DNA와 RNA를 동시에 분리할 수 있습니다. Sample volume에 따라 micro, mini kit을 선택할 수 있습니다.
RNA, protein 정제
AllPrep RNA/Protein Kit (#80404) 를 이용하면 같은 cell sample로부터 RNA와 native protein을 동시에 분리할 수 있습니다. 정제된 protein에는 모든 cellular protein이 포함되어 있어 enzyme assay 실험에 사용할 수 있습니다.
| DNA, RNA, protein의 정제 | Sample Type | Cat No. | Product | Description |
| Cells & Tissue | AllPrep DNA/RNA/Protein Mini Kit | gDNA, 200 nt 이상의 total RNA, denatured protein 추출 | ||
| AllPrep DNA/RNA Mini Kit | gDNA, 200 nt 이상의 total RNA 추출 | |||
| AllPrep DNA/RNA Micro Kit | 소량의 샘플에서 gDNA, 200 nt 이상의 total RNA 추출 | |||
| AllPrep DNA/RNA/miRNA Universal Kit | gDNA, microRNA를 포함한 total RNA 추출 | |||
| Cells | AllPrep RNA/Protein Kit | 200 nt 이상의 total RNA, native protein 추출 | ||
| FFPE tissue | AllPrep DNA/RNA FFPE Kit | Genomic DNA, small RNA를 포함한 total RNA 추출 |
효과적인 Genomic DNA 제거
RNA를 정제하는 과정에서 함께 정제된 genomic DNA는 Real-Time PCR과 같은 정밀한 유전자 분석 실험의 정확성을 떨어뜨리는 요인이 될 수 있습니다. Genomic DNA는 PCR 과정에서 RNA와 함께 증폭, detection되기 때문에 target RNA의 정량 값을 신뢰할 수 없게 됩니다. Target RNA에 대한 특이적인 primer를 디자인함으로써 (primer가 intron splice junction에서 annealing 되도록 디자인) genomic DNA가 함께 증폭하는 것을 어느 정도 방지할 수 있겠지만, 이러한 방법이 항상 가능하지 않을 수 있습니다. 따라서 QIAGEN에서는 RNA를 정제하는 과정 또는 cDNA로 합성하기 바로 전에 genomic DNA를 효과적으로 제거할 수 있는 제품들을 보유하고 있습니다.
1. RNase-Free DNase Set : RNA 정제 과정 중 또는 RNA 정제 후 gDNA를 제거할 수 있는 DNase Set. QIAGEN의 RNeasy Mini Kit 와 함께 사용 가능
2. RNeasy Plus Kits : gDNA를 제거할 수 있는 column 또는 solution이 포함된 RNA purification kit
3. QuantiTect Reverse Transcription Kit : gDNA Wipeout Buffer가 포함된 RT kit
| gDNA 제거 | Step | Cat No. | Product | Description |
| RNA purification 과정 중 gDNA 제거 | RNase-Free DNase Set |
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| RNeasy Plus Micro Kit |
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| RNeasy Plus Mini Kit | ||||
| RNeasy Plus Universal Mini Kit |
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| RNeasy Plus Universal Midi Kit | ||||
| cDNA 합성과 동시에 gDNA 제거 | QuantiTect Reverse Transcription Kit |
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| QuantiNova Reverse Transcription Kit |
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